Σκοποί της Ένωσης Αγροτουρισμού είναι:

•  η μελέτη και προώθηση επίλυσης των προβλημάτων των επιχειρηματιών αγροτουρισμού και ο συντονισμός της δράσης για την επίλυσή τους,
•  η συμβολή στην ανάπτυξη των υπηρεσιών αγροτουρισμού, ώστε να προσφέρονται καλύτερες υπηρεσίες, να προσελκύονται περισσότεροι επιχειρηματίες και να αυξάνεται η ζήτηση,
•  η αξιοποίηση της τεχνογνωσίας της α.μ.κ.ε. ΑΓΡΟΞΕΝΙΑ με αίτηση γνώμης, και
•  η προώθηση με κάθε νόμιμο μέσο των συμφερόντων των μελών της.

 Η είσοδος και η εγγραφή των νέων μελών επιτρέπεται καταρχήν ελεύθερα. Για να εγγραφεί κάποιος ως μέλος της Ένωσης πρέπει να είναι Έλληνας υπήκοος, να έχει συμπληρώσει το 18° έτος της ηλικίας του, να είναι επιχειρηματίας αγροτουρισμού (ΑΦΜ και Έναρξη επιτηδεύματος - ΣΤΑΚΩΔ) και να μπορεί να ανταποκρίνεται στις υποχρεώσεις του μέλους.